Îïåðàöèîííàÿ ñèñòåìà FreeDos ïîçèöèîíèðóåòñÿ ðàçðàáîò÷èêàìè, êàê ñîâìåñòèìàÿ ñ MS-DOS íà 100%. Âî âñÿêîì ñëó÷àå, îíè ê ýòîìó ñòðåìÿòñÿ. Ïîìèìî ïðî÷åãî, îíà óìååò ïîíèìàòü äëèííûå èìåíà è ôàéëîâóþ ñèñòåìó FAT32.  êîìïëåêò ê çàãðóç÷èêó ïðèëàãàåòñÿ íàáîð ñèñòåìíûõ óòèëèò.